梁元帝最终没有采纳他的建议。

承圣三年（554）年底，西魏上柱国于谨，率宇文护、杨忠（杨坚的父亲）、韦孝宽等大将攻陷江陵，杀死梁元帝。庾季才也被掳至北方。

不久后，北周取代西魏，而庾季才仍然担任太史之职。他受诏撰成《灵台秘苑》一书。该书一百二十卷，是隋朝以前星象学的汇总之作，与唐开元年间印度裔的太史令瞿昙悉达所撰《开元占经》一起被称为中国古代占星学的双璧。

顺便提一句的是，现在所流行的西方星座，即起源古巴比伦的黄道十二宫至迟在唐朝时期就由印度传入了中国，并对中国的星命术和其它术数（如面相也分十二宫）产生了深远影响。只是从宋朝起子平术（就是一般所说算八字）兴起，星命术才逐渐衰落下来。即便如此，在明朝万民英撰的《星学大成》里仍有大量十二星座的内容。

杨坚早闻庾季才的盛名。当年北周重臣宇文护专权之时，也曾向庾季才请教。没想到庾季才让他归政天子、离休回家。宇文护当然不干，最后被周武帝设计诱杀。那些个曾假托符命、向宇文护劝进的伪大师们政治投机失败，纷纷受株连被杀。而庾季才却受到封赏，升任骠骑大将军、开府仪同三司。